一行代碼解決問題！

console.log([...str].map((val) => arr.indexOf(val) > -1 ? val = '替換字符' : val));

因為問題主人修改了問題，答案驢唇不對馬嘴。自刪。

var str = "一二三五一二五"
var arr = ["一","五"]
str.replace(new RegExp("["+arr+"]","g"),"#")//#二三##二#

var str = "一二三四一二三四一二三四一二三四";
var arr = ["一", "三", "五"];
var reg = new RegExp(arr.join('|'), 'g');
str = str.replace(reg, "");
console.log(str);   // "二四二四二四二四"

var str = "一二三四一二三四一二三四一二三四";
var arr = ["一", "三", "五"];
var replaceWord ="R";//需要替換的字符
var replacedStr = str.split('').map((item) => {
    return -1 == arr.indexOf(item)?item:replaceWord;
})

可以使用正則, #可以替換為你想要的
    str.replace(new RegExp(arr.join('|'), 'g'), "#")