不確定你怎么做的，是不是笛卡爾積了

我不知道你的具體場景是什么，所以可以幫到你的不多。

之前我也接觸類似難度的項(xiàng)目，這里分享一點(diǎn)建議。

1. 在數(shù)據(jù)上進(jìn)行優(yōu)化，例子：使用 matrix 取代 data frame
2. 使用 bigmemory或ff，底部為C++，這是R用戶常用來處理大數(shù)據(jù)的包
3. 考慮使用 spark或者hadoop，對接到R環(huán)境。

你還可以同時(shí)在阿里云或者亞馬遜上啟動一臺超級服務(wù)器，把硬件的局限降到最低。

這里有份文章，可以作為參考。