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鍍金池/ 問答/Python/ python 最后一列分類并統(tǒng)計頻率的問題

python 最后一列分類并統(tǒng)計頻率的問題

前兩列是位點信息，希望統(tǒng)計同一個位點下，第三列x有多少個，X有多少個，在python中應(yīng)該用什么方法能比較快的實現(xiàn)呢

Chr1 1001 x

Chr1 1001 X

Chr1 1001 x

Chr1 10018 X

Chr1 1002 x

Chr1 1002 X

目前我想的是根據(jù)前兩列為鍵，最后一列是X和x的頻率為值，建立兩個字典，然后分別輸出成兩個文件，怎么輸出成一個列表類似：
chr loc x X
Chr1 1001 2 1
chr1 1002 1 1
chr1 10018 0 1

回答
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初心

可只用一個字典，以前二列為鍵，值為元組，第一項是X頻率，第二項是x頻率

if value == 'X':
    freq_dict[('chr', 'loc')][0] += 1
if value == 'x':
    freq_dict[('chr', 'loc')][1] += 1
2017年12月3日 14:44
編輯回答
舊顏

思考了一下，好像可以通過列表解決，tlist統(tǒng)計所有行，mlist統(tǒng)計只有X的行，uniqlist統(tǒng)計不重復(fù)行
通過遍歷uniqlist統(tǒng)計X行和x+X行的個數(shù)

tlist=[]
mlist=[]
uniqlist=[]
for l in  f.readlines():
        line = l.strip().split("\t")
        loc="\t".join(line[0:2])
        tlist.append(loc)
        uniqlist=list(set(tlist))
        if line[2]=="X":
                mlist.append(loc)
                for i in uniqlist:
                       out.write(i+"\t"+str(uniqlist.count(i))+"\t"+str(mlist.count(i))+"\n")
2018年4月23日 01:15